ראש רשות המסים, יהודה נסרדישי, מתנגד לשינוי מיסוי הנדל"ן בישראל. נסרדישי מתנגד במיוחד להטלת מס שבח על דירה להשקעה, ומעדיף את השימוש במס רכישה כמקור להכנסות ממסים. ראש מינהל הכנסות המדינה, פרידה ישראלי, תומכת בעמדתו של נסרדישי.

לדברי נסרדישי, בעקבות החלטת הממשלה ממאי לבחון את מיסוי הדירות בישראל, ערכו רשות המסים ומינהל הכנסות המדינה בחינה מחדש של מיסוי הנדל"ן. הבחינה נדרשה, בין השאר, לאחר שהתברר כי המס המוטל על רווחים מהשקעה בדירות - מס שבח - אינו אפקטיבי, ובפועל אין הכנסות ממס זה. ב-2009 היקף ההכנסות של מס שבח מדירות מגורים להשקעה יהיה פחות מ-200 מיליון שקל.

למעשה, עיקר ההכנסה ממיסוי דירות מגורים, בסך 3.5 מיליארד שקל בשנה, מקורו במס רכישה המשולם בעת רכישת הדירה ועל מלוא מחיר הדירה. המס שאמור להיות משולם עם מכירת הדירה, ורק על הרווח הנובע מההשקעה - מס שבח - כמעט ואינו קיים.

על אף שזהו המצב, ההמלצה של רשות המסים ושל מנהל הכנסות המדינה היתה שלא לערוך שינוי במיסוי הנדל"ן בישראל. לדברי נסרדישי, הדבר נובע קודם כל מהבעייתיות בגביית מס שבח. כך, מס שבח אמור להיות מוטל רק על דירה להשקעה (דירה שנייה ויותר) ולא על דירת המגורים (דירה ראשונה), ורשות המסים נתקלת בבעיות טכניות להבחין בין שני המצבים.

בנוסף, אם ישונה מס שבח על דירות להשקעה, יהיה צורך במקביל לאפשר גם הכרה בהוצאות על רכישת הדירה. הדבר יסבך שוב את מערכת הגבייה, ויקטין מאוד את פוטנציאל הכנסות הגבייה ממס זה.

לדברי נסרדישי, הסיבה העיקרית להמלצה שלא לשנות את מיסוי הנדל"ן בישראל ולא להטיל מס שבח על דירה להשקעה, היא שהמס הקיים - מס רכישה - הוא אפקטיבי דיו למטרה זו. מס רכישה מוטל גם על דירת מגורים וגם על דירה להשקעה, אבל במקרה של דירה להשקעה הוא גבוה בהרבה - שיעורו מגיע ל-3.5% ממחירן של דירות זולות, ו-5% ממחירן של דירות יקרות. נסרדישי מעריך כי מס של 5% ממחיר הדירה - המצב הנפוץ בדירות להשקעה - משקף בפועל את הרווח הצפוי מהדירה למשך 10-15 שנה, וזאת כאשר כל המס משולם מראש (עם הרכישה, ולא עם מימוש הדירה בעוד עשר שנים ויותר).

לדברי נסרדישי, "מס רכישה הוא תחליף למס שבח, ואין סיבה מקצועית לעשות שינוי במס הזה".